Андромеда (2000-2005)

Содружество Систем уже восстановлено, но большого прогресса в борьбе с Магогами и Бездной нет.
«Андромеда» получает отлично обученную команду из Звёздной Гвардии, которая вскоре покидает основную команду, имеющую дело с проблемами на корабле. Несмотря на то «Андромеда» — «самый мощный и непобедимый корабль в Галактике», её не раз превосходят маловероятные противники: одинокий Ницшеанский крейсер, стреляющий гамма-лучами или стреляющие отходами корабли.
Ницшеанский член команды Тир Анасази делает свой ход - он внедряет ДНК своего сына Тамерлана Анасази в самого себя, и начинает воссоединять различные Ницшеанские племена, снова отделяя их от Содружества Систем. Ницшеанцы покидают Содружество, а Тир Анасази оставляет «Андромеду»...